โรงเรียนวัดจินดาราม ก่อตั้งเมื่อวันที่ ๑ ตุลาคม พ.ศ. ๒๔๗๗ ผู้ดำเนินการก่อตั้งคือ ขุนนครรัฐเขตต์ นายอำเภอสามพราน นายหิรัญ สามชัย ศึกษาธิการอำเภอสามพราน พระอธิการปลัดเปลื้อง เจ้าอาวาสวัดจินดารามและนายพิณ บุญสม กำนันตำบลตลาดจินดา โรงเรียนแห่งแรกใช้ศาลาการเปรียญวัดจินดาราม ผู้บริหารโรงเรียนคนแรก ชื่อ นายชิน ศิริทรัพย์ เป็นครูใหญ่ ได้งบประมาณจากทางราชการก่อสร้างอาคารเรียนถาวรแบบวัดสัมปทวน ๑ หลัง ตั้งอยู่บนที่ดินของวัด ๘ ไร่
ต่อมาได้มีการปรับปรุงพัฒนาด้านอาคารสถานหลายครั้ง ในปัจจุบันมีอาคารถาวร ๔ หลัง ๓๓ ห้องเรียน ได้รับความร่วมมือจากครู ผู้ปกครองและชุมชน ช่วยกันบริจาคสร้างอาคารหอประชุมแบบ ๑๐๐/๒๗ มูลค่า ๔๗๐๐,๐๐๐ บาท และซื้อที่ดินเพื่อให้โรงเรียนใช้ประโยชน์อีก ๕ ไร่ มูลค่า ๑,๐๐๐,๐๐๐ บาท นอกจากนี้ องค์การบริหารส่วนจังหวัดนครปฐมได้อุดหนุนเงินสร้างอาคารและถนนคอนกรีตในโรงเรียน มูลค่า ๔,๐๐๐,๐๐๐ บาท (ประชาชนสมทบ ๑,๐๐๐,๐๐๐ บาท)
ปัจจุบันเปิดสอนตั้งแต่ระดับก่อนประถมศึกษา ระดับประถมศึกษา ระดับมัธยมศึกษาตอนต้น มีนักเรียน ๑๑๙๒ คน ข้าราชการครู ๑ คน ครูจ้างสอน ๙ คน ภารโรง ๑ คน นายชำนาญ ทัดมาลี เป็นผู้อำนวยการสถานศึกษา